Joep Janssens Forschungsinteressen liegen im interdisziplinären Zugang zur Musikgeschichte, mit besonderem Augenmerk auf der Analyse von musikalischen Topoi und der Verbindung von Natur, Politik und Identität im 19. Jahrhundert. In seiner Bachelorarbeit untersuchte er die historische Entwicklung vom Topos der Ekstase in den Klaviersonaten Alexander Skrjabins. Mit seiner bei der Österreichischen Gesellschaft für Musik präsentierten Masterarbeit zum Thema der musikalischen Topoi des Waldes in der Klaviermusik des 19. Jahrhunderts verband er musikalische Notenanalyse mit literatur-, sozial- und umwelthistorischen Prozessen. Im Rahmen der internationalen Tagung "Musik und Klimawandel" an der Folkwang Universität der Künste in Essen hat er sich weiter in der Verbindung zwischen Musikgeschichte und Natur vertieft. Hier präsentierte er anhand der „Erscheinung zweier Landschaftstypen im Klaviercharakterstück“ die These, dass Kunst eine bedeutende Rolle im Kontext der sich wandelnden Verhaltensweise gegenüber der Umwelt im 19. Jahrhundert gespielt hat.

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